Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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