Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms