Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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