Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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