Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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