Protein–RNA interactions for Protein: Q13642

FHL1, Four and a half LIM domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL1Q13642 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FHL1Q13642 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms