Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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