Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FOXF2Q12947 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FOXF2Q12947 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXF2Q12947 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXF2Q12947 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXF2Q12947 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXF2Q12947 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FOXF2Q12947 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FOXF2Q12947 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FOXF2Q12947 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FOXF2Q12947 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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