Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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