Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP160Q12769 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP160Q12769 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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