Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms