Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms