Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLOD1Q02809 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PLOD1Q02809 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms