Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTA1P68133 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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