Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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