Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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