Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEC13P55735 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEC13P55735 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SEC13P55735 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SEC13P55735 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEC13P55735 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEC13P55735 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEC13P55735 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SEC13P55735 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEC13P55735 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEC13P55735 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEC13P55735 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC13P55735 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC13P55735 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms