Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NAPAP54920 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NAPAP54920 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NAPAP54920 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NAPAP54920 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms