Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIRAP54198 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIRAP54198 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIRAP54198 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms