Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPAP53621 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms