Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THOP1P52888 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms