Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DAP3P51398 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DAP3P51398 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DAP3P51398 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DAP3P51398 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DAP3P51398 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DAP3P51398 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DAP3P51398 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms