Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms