Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ME1P48163 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ME1P48163 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms