Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms