Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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