Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms