Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA4P35212 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GJA4P35212 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GJA4P35212 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms