Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms