Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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