Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms