Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GCSHP23434 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GCSHP23434 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
GCSHP23434 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GCSHP23434 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GCSHP23434 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
GCSHP23434 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GCSHP23434 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
GCSHP23434 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GCSHP23434 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
GCSHP23434 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
GCSHP23434 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GCSHP23434 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GCSHP23434 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GCSHP23434 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GCSHP23434 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GCSHP23434 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GCSHP23434 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GCSHP23434 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GCSHP23434 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GCSHP23434 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms