Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms