Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK11BP21127 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms