Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT4P19013 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT4P19013 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms