Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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