Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CREB1P16220 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CREB1P16220 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CREB1P16220 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CREB1P16220 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CREB1P16220 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CREB1P16220 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CREB1P16220 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms