Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms