Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms