Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI3P10071 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI3P10071 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI3P10071 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI3P10071 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI3P10071 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI3P10071 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI3P10071 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI3P10071 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI3P10071 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI3P10071 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI3P10071 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms