Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLTBP09497 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLTBP09497 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLTBP09497 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLTBP09497 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLTBP09497 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLTBP09497 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLTBP09497 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLTBP09497 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLTBP09497 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLTBP09497 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLTBP09497 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLTBP09497 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLTBP09497 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLTBP09497 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLTBP09497 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLTBP09497 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLTBP09497 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLTBP09497 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLTBP09497 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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