Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCATO75600 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCATO75600 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCATO75600 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms