Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms