Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms