Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms