Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms