Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms