Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FOXD3Q9UJU5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FOXD3Q9UJU5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FOXD3Q9UJU5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FOXD3Q9UJU5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FOXD3Q9UJU5 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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