Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms