Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCF2Q9UG63 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms